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Ces eaux de l’estuaire abritent une grande quantité de poissons migrateurs :
La lamproie
La saison commence en avril avec les lamproies (marines ou fluviales) qui constituent un met emblématique de la cuisine bordelaise.
Grâce à sa bouche ventouse, la lamproie qui est un vertébré s’agrippe aux poissons afin de se nourrir de leur sang.
On la pêche avec des nasses posées sur le sable ou au filet dérivant lorsqu’elle remonte l’estuaire pour frayer en eaux douces.
L'alose
Le printemps annonce également la pêche à l’alose (alose feinte ou grande alose) qui se pratique à l’aide de filets à marée montante.
La piballe
 Mais la pêche la plus lucrative a lieu en hiver lorsque l’alevin de l’anguille (piballe ou civelle) d’à peine 7 cm remonte l’estuaire pour rejoindre les eaux douces et atteindre sa taille adulte.
On pratique cette pêche à l’aide d’un haveneau, filet-poche à mailles fines porté à l’avant du bateau et relevable grâce à un système de poulies.
On peut aussi la pêcher directement à partir du rivage en utilisant le pibalour, tamis porté au bout d’une longue perche en bambou.
L'esturgeon
L’esturgeon européen est le légendaire poisson-roi de l’estuaire, le plus grand que l’on puisse rencontrer dans les eaux douces d’Europe (il dépasse parfois 2,5 mètres).
L’esturgeon ou « créac » n’est mature que vers 14-18 ans. Il remonte alors l’estuaire de février à mai pour aller pondre dans les eaux douces. Les juvéniles vivent deux ans dans l’estuaire avant de rejoindre l’océan.
Pêché pour sa chair au XIXe siècle, l’esturgeon va devenir à partir de 1920 une ressource majeure du fleuve avec l’utilisation de ses œufs comme caviar. Les pêches massives et la destruction des frayères par extraction des graves ont provoqué sa quasi disparition. L’espèce est protégée depuis 1982.
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L'estuaire 
Office de Tourisme Cantonal